Mot individanpassad behandling vid SLE – med hjälp av genetik och artificiell intelligens.

Bakgrund och motivering

Systemisk lupus erythematosus (SLE) är en komplex autoimmun sjukdom som påverkar flera organ, som njurar, hud och nervsystemet. Den drabbar ofta unga kvinnor och har ett oförutsägbart förlopp med inflammation som kan skada organ och minska livskvaliteten. Ärftliga faktorer har stor betydelse för sjukdomens utveckling och svårighetsgrad, men trots att många genetiska riskvarianter är kända används denna information ännu inte inom sjukvården.

Syfte och mål

Målet med vår studie är att möjliggöra tidigare och mer skräddarsydd behandling för personer med SLE genom att använda information om deras gener. Genom att kombinera genetiska data med kliniska och immunologisk information vill vi bättre förstå hur sjukdomen utvecklas och varför den ser olika ut hos olika personer.

Specifika mål:

• Ta fram modeller som kan förutsäga hur sjukdomen kommer att visa sig och vilken behandling som fungerar bäst, baserat på genetisk risk, blodprover och sjukdomshistorik.

• Undersöka vad som händer i immunceller och njurvävnad hos patienter med hög genetisk risk för att förstå svår SLE bättre.

Metod

Vi kommer att samla in och analysera genetisk, serologisk och klinisk data från över 2400 patienter med SLE. Genom att beräkna polygenetiska riskscore kan vi kvantifiera varje patients ärftliga risk för sjukdomen. Med hjälp av maskininlärning, en form av artificiell intelligens, utvecklas modeller som kopplar genetiska och kliniska data till olika sjukdomsformer och behandlingssvar. Vi studerar också immunceller och njurvävnad från patienter med både hög och låg genetisk risk, med avancerade metoder som single-cell RNA-sekvensering, ATAC-sekvensering och spatial transcriptomik, samt analyserar proteinprofiler för att få en djupare bild av sjukdomens mekanismer.

Betydelsen för patienten

Forskningsprogrammet syftar till att utveckla modeller som på sikt kan ingå i ett kliniskt verktyg för att förutsäga sjukdomsförlopp och behandlingssvar vid SLE. Vi vill också förstå hur den samlade genetiska risken påverkar immunsystemets funktion. Detta arbete ska lägga grunden för bättre, mer individanpassade behandlingar och skapa förutsättningar för precisionsmedicin vid SLE, vilket kan förbättra patienters livskvalitet och minska sjukdomens konsekvenser på lång sikt.