Precisionsmedicin vid Systemisk Lupus Erythematosus - koppling mellan genetik och klinik

Dag Leonard , Uppsala Universitet, 200 000 kronor, 2-årsanslag år 1/2022

Bakgrund och motivering

SLE är en reumatisk sjukdom som kan påverka många olika organ i kroppen. Sjukdomen skiljer sig mycket från patient till patient och många har en sänkt livskvalitet. Genetiska studier  har identifierat över 100 riskgener för sjukdomen vilket har bidragit till förståelsen av de bakomliggande sjukdomsmekanismerna. Tyvärr har denna kunskap inte kommit till användning inom sjukvården. I detta projekt kommer jag att skapa en genetisk karta för den enskilda patienten som kan användas i klinisk praxis.

Syfte och mål

Syftet med detta projekt är att klargöra genetikens betydelse för sjukdomens olika manifestationer. Vi kommer genom analys av polygenetisk risk utveckla ett genetiskt instrument som kan användas av läkaren och patienten tidigt under sjukdomsförloppet för att förutsäga vilken typ av SLE patienten har, vilka miljöfaktorer som bör undvikas, vilken behandling som kan fungera bäst och hur uppföljningen ska planeras.

Specifika mål:

Studera genetikens betydelse för kardiovaskulär sjukdom vid SLE

Utveckla polygenetiska riskscore för olika manifestationer och respons av behandlingar

Studera interaktioner mellan gener och miljöfakftorer

Metod

Patienter med SLE från Sverige och Norge (n=1760) har genotypas med Illuminas Global Screening Array. Genom imputering finns nu data för ca 5 miljoner genvarianter för varje patient. Klinisk data har sammanställts och viss komplettering av informationen pågår. Patienterna kommer delas in i två kohorter. Polygenetiska riskscore (PRS) för olika manifestationer kommer att utvecklas i discoveykohorten för att därefter testas i replikationskohorten. PRSs kommer utvecklas för olika organmanifestationer, kardiovaskulär sjukdom, läkemedelsbiverkningar, behandlingsrespons och sjukdomsaktivitet. Interaktionsanalys kommer göras mellan olika riskgenvarianter (gen-gen) och miljöfaktorer (gen-miljö) såsom solkänslighet, rökning och exponering för infektioner.

Betydelsen för patienten SLE är en kronisk reumatisk systemsjukdom som ofta debuterar tidigt i livet. Trots bättre kontroll av sjukdomen drabbas patienterna fortsatt av organskador såsom hjärt-kärl sjukdom och njurfunktionsnedsättning.  I denna studie  kommer vi  utveckla en genetisk karta som ska användas av patienten och läkaren tidigt i sjukdomsförloppet för att prediktera vilken typ av sjukdom just denna person har. Med denna information kommer man kunna veta vilka miljöfaktorer som patienten bör undvika, vilken behandling som kan fungera och hur man bäst ska följa patienten under kommande år.